Molecular Notes

Robert Andrew Martin によるデジタルノート法。

Molecularは分子のこと。Atomを組み合わせて分子を作る、という構造。

Molecular Notes: Principles

ステム「Molecular Notes」を紹介します。モレキュラーノートは、私の第二の脳、つまり、個人的にも仕事上も、世界を理解するのに関連する概念やアイデアの集合体へのアプローチ方法です。

私は一般的に、具体的な事実よりも、メンタルモデルを探し求めるようにしています。ある意味、この記事は、私の思考、情報の蓄積、メンタルモデルの構築に関するメンタルモデル、いわばメタ・メンタルモデルという、最も有用なものを伝えようとしているのです。金融や数学の雑学を書くのは楽しいが、その価値がわからないということはないだろう。好奇心（主に私自身）を刺激し、巧妙な定量的手法を探求し、興味深い関連性を概説するためのものである。この投稿は、もっと壮大な野望を抱いています。

第1部では、セカンドブレインの概念とモレキュラーノートの原理を紹介します。また、他のセカンドブレインシステムであるZettelkastenとEvergreen NotesとMolecular Notesを比較します。第2部では、実装について説明します。ソフトウェアのオプションについて説明し、私が実際に使っているワークフローを含むObsidianでのセットアップの詳細なウォークスルーを提供し、私のセットアップを模倣できるようにフォーク可能なGitHubレポも提供します。

この記事は詳細なもので、テーマの紹介と基礎固めにかなりの時間を費やします。目次を参考にしてください。

草稿を読んでくれたNiamh QとShiv Gに感謝します。

What is a Second Brain

私の定義

セカンド・ブレインとは、私が気になる情報（具体的には、概念やアイデア）を消費し、相互作用するためのシステムである。

私の定義では、セカンドブレインは「個人的な知識管理」（PKM）のサブセットであり、Todo、目標、計画といったものは含まれません。私の定義では、Todoや目標、計画といったものは含まれず、代わりにタスク管理やプロジェクト管理に分類しています（PKMのこれらの側面についてNotionを使うという私の投稿をご覧ください）。注：これは普遍的なことではありません。セカンドブレインにタスク管理を含める人もいますが、セカンドブレインに使われる技術やソフトウェアツールは、PKMの他の分野とはかなり異なるので、別々に考えるのが便利だと思います。

著者のPKMの概念構造

PKM

Task Mgmt

Project Mgmt

Second Brain

私の定義をさらに分解してみます。

「システム(System)」です。システム」：新しい情報をどのように自分の思考に取り入れるかについて、その場しのぎの判断をするのではなく、プロセスを持つべきである。

「消費と相互作用(Consuming and interacting with)」：私の脳は単なるハードドライブではなく、知識グラフを横断して計算を行います。適切なセカンドブレインは、この2つの機能を提供する必要があります。

「情報（特に概念やアイデア）(Information (specifically concepts and ideas))」：前述のように、私のセカンドブレインはプロジェクトやタスクの管理は行いません。純粋に概念、洞察、アイデアを扱います。

「私が気になるもの(That I care about)」：目標は、これまで出会ったすべての学習リソースを忠実に表現することではありません。それよりも、自分の思考（個人的なものでも仕事でも）に関連する概念のマップが欲しいのです。

私は数年前からセカンドブレインに取り組んでおり、ソフトウェアツールを切り替え、ワークフローを刷新し、アプローチを進化させてきました。今、この記事を書いているのは、私のシステムの哲学が平衡点に達したと感じたからです。しかし、仕組みは「永久ベータ版」であり、私は常に改善のために手を加えています。

さらに、このシステムを使って、自己啓発と専門的な学習の両面で価値を生み出すことができると確信しています。私は、インターンシップでこのシステムを維持し、複雑なテーマについて効果的に学び、実用的な洞察を導き出すために使いました。

Objectives

私は、多くの読者と同じように、ナレッジワーカーです。Wikipediaによると、ナレッジワーカーの仕事は「生活のために考える(think for a living)」ことであり、情報を消費し、それを賢く処理し（そのためには既存の情報を利用したり、新しい技術を学ぶ必要があるかもしれません）、そしてその出力を関係者に伝達することです。

セカンド・ブレインの基本的な目標は、ナレッジワーカーとしての能力を向上させることです。これは、いくつかの具体的な目標に現れています。

複合的なメディアから複雑なトピックを素早く学ぶ

洞察力と理解力を保持する

O(N2)成長

新しいアイデアの合成

積極的な学習習慣を促す

それぞれを順番に取り上げています。

1. Rapidly learning complex topics from mixed media forms

私はこうまとめています。

情報源を消費するためのプロセスを持つこと。

ピースの組み合わせがわかるような形で。

必要であれば、より詳細なリソースを紹介する。

セカンド・ブレインのノートには、すべての詳細を記載するのではなく、重要なアイデアのみを記載します。インターネット時代、重要なのは、概念のつながりを知り、そのためにどのようなツールを使うかを知ることです。もし、詳細が必要になったら、元の資料を参照すればいいのです。

2. Retaining insights and understanding

私はこれまで何度も（特に大学時代）、あるコンセプトを本当に理解するために、直感的なレベルで理解する努力を重ねてきました。そのためには、直感的に理解できるまで、さまざまな記事を読んだり、紙にアイデアを書き出したりします。

ところが、数週間後、数カ月後、せっかく身につけた理解を忘れてしまっていることに気づくのです。これは非常に悔しいことです。この理解を再構築するには、さまざまな資料を参照する必要があり、簡単なことではありません。このようなことが起こらないようにすることが、モレキュラーノートの開発の重要な動機でした。

具体的には、優れたセカンドブレインは、過去に自分が持っていたものと同じレベルの理解を迅速に達成することができるはずです。このことは、その理解の断片が他の多くの知識の断片を条件としているような状況ではより困難かもしれませんが、その場合でも、私は直感を再構築できるように、関連する概念の局所的な風景を素早く横断することができるはずです。

3. O(N2)growth

私は、自分の知識や能力が、単に消費するものの数だけ直線的に成長することを望んでいません。私の知識は、O(N2)倍になるようにしたいのです。

- quadratically. 読むものの数を2倍にすれば、知っていることも4倍になるはずです。

どうすればそれを実現できるのか。思考を連動させることです。それぞれの知識を単独で扱うのではなく、自分の既存の知識体系とリンクさせるようにしたいのです。新しい知識の断片は、私が知っている他のすべての事柄とつながる可能性があるのです。

これは二次関数的なもので、N個の部屋で可能な握手の総数は

peopleはN2オーダー、具体的には12N(N-1)である。

. 私は、新しい知識の断片が、他のすべての知識の断片と "握手 "することを望んでいます。

注：真のO(N2)を持つことは可能でも望ましくもない。

知識の一部は単に関連していないだけなのです。むしろ、この目標は、リンクした思考と、それがもたらす超直線的な成長の重要性を強調するために存在します。

4. Synthesising New Ideas

機械の仕組みを理解することは重要です。しかし、より良いのは、システムの修正や改良を提案し、発明や革新を行うことができることです。

私の第二の脳は、複雑なトピックを理解するだけでなく、そのトピックに新しい視点を持ち、新しい方向性を見出すことができるはずです。教育心理学の用語では、創造はブルームの分類法の最上位に位置します。

もちろん、合成はセカンドブレインのシステムそのものではなく、ユーザーの実際の脳の創造性に依存するものですから、セカンドブレインのシステムとして必要不可欠なものではありません。

5. Encouraging positive learning habits

簡単に言うと、喜びを感じられるシステムであることです。これは主にツールの選択に起因するもので、カスタマイズ可能で、使っていて楽しいツールであるべきです。

しかし、中毒性のある技術に関する文献から得られる貴重な洞察もあります。例えば、Nir Eyalの著書「Hooked」に記載されているHookモデルです。Eyalは、習慣形成技術には以下のものが必要だと考えています。

トリガー：外的要因（例：通知）または内的要因（例：起床時に定期的にニュースをチェックする）。

行動：報酬を期待して行う行動

変動報酬型

投資：ユーザーが製品に時間を投資する

フックモデルに沿ったシステムを構築できる分、楽しみながら習慣化できそうです。

Summary – Objectives

それはいろいろとありますね。しかし、本当に私が打ち出したいことはこれです。

セカンドブレインシステムは、教科書やオンラインコース、論文から、コンセプトを理解し、そのコンセプトを私生活や仕事に応用できるように学習できるようにするものです。

Molecular Notes

この数年間、私は様々なノートの取り方を試し、何度も自分のシステムを破り、またやり直すことを繰り返してきました。そして、最終的にたどり着いたのが、「モレキュラーノート」と名付けたシステムです。

モレキュラーノートは創発的なシステムであることを強調したい。私が先に述べたような目的を達成するためにトップダウンで設計されたのではなく、過去2、3年の間に多くの小さな改良から進化してきた。一方では、このことがより安定した堅牢なシステムへとつながっています（創発システムには一般的に言えることですが）。一方で、この記事を書いていて、システムの創発的な性質が、意外と説明を難しくしていることが多いことに気づきました。最善を尽くしますが、もし理解できない部分があるとしたら、その責任は私にあります。問題のある段落をメールで送っていただければ、言い換える努力をしますよ。

Molecular Notesの3つのプリミティブは以下の通りです。

ソース：書籍、教科書、オンラインコース、ポッドキャスト、Youtubeビデオ、学術論文、プレゼンテーションなど、あらゆる情報源。

アトム：既存の概念や技術。経験則から、これらにはWikipediaの記事があることが多い。

分子（Zettelkastenシステムの「zettels」に似ている）：結晶化した洞察、直感の断片、アトム間のリンク、私のアイデア。

これらはトピックスで整理されています。

Molecular Notesの全体的なワークフローは以下の通りです。

ソースから原子を抽出し、原子から分子を作り、トピックスですべてを整理する。

Sources

Sourceとは、私が学びたいと思うあらゆる情報媒体のことです。私が扱う主な情報源は、ノンフィクションの書籍、教科書、ポッドキャスト、オンラインコース、YouTubeビデオです。

以前にも書きましたが、私のメンタルモデルは、情報源（特に書籍）は通常、次のようなもので構成されているというものです。

コンセプト：著者のオリジナル、または著者が論文の一部として参照する確立されたコンセプト。

コンセプトを説明するための追加的な詳細、文脈、および例。

テーゼ：コンセプトが他のコンセプトとどのようにリンクしているか、著者が解説/説明する。

私のメモの取り方は、このモデルを反映しています。私は、重要な概念に言及しながら、出典の核となる論旨を（できるだけ簡潔に）捉えたいと考えており、また、1つか2つの最良の例を挙げています。

例えば、NNTの『ブラック・スワン』では。

コンセプトは ブラックスワン - 稀で、極めて衝撃的で、本質的に予測不可能な出来事。

例 NNTは、金融や歴史からいくつかの例を挙げている。

テーゼ

歴史の大半はブラックスワンによって決定されている

過去から学ぶことに慎重であるべき

ポジティブなブラックスワンを集めよう

このモデルは普遍的なものではなく、一部のソース、特に教科書のような技術的なソースは、論文を持たずにコンセプトやテクニックを提示することに重点を置いています。また、オピニオン・ピースのように、コンセプトの説明よりも論文に重点を置いているソースもあります。また、「コンセプト」の定義は少し緩やかで、例えば、歴史に関する情報源は、コンセプトではなく事象を論じていますが、私はこれを「コンセプト」に分類して考えています。

いずれにせよ、私が言いたいのは、ソースには、ソースに「固有の」知識の断片と、ソースとは別に存在する知識の断片があるということです（ソースで頻繁に言及されていたり、著者が実際に発明していたりする場合でも）。モレキュラーノートはこの区別を支持しています。

複数の情報源からノートを取る場合、多くの概念が情報源間で重複していることに気づきます。例えば、ブラック・ショールズ・モデルはオプションに関するすべての教科書で取り上げられていますし、物語の誤謬は意思決定に関する多くの本で説明されています。もし私が、これらの概念に言及するすべてのソースノートでこれらの概念を説明し直すとしたら、重複が多くなってしまうでしょう。次に「パラダイムシフト」について再認識しようと思ってメモ帳で検索すると、その定義が10個のソースで表示されるので、圧倒されることになる。

これは、分子ノートの重要な考え方の1つにつながります。概念を個々のノート（アトム）に抽出し、ソースからリンクさせるのです（Obsidianのような最新のノート作成ソフトウェアでは、これが簡単にできます）。

アトムの思想については、次の章で詳しく説明しますが、ソースノートの例で説明すると分かりやすいと思います。以下は、Andrew Lo氏の「Adaptive Markets」に対する私のメモです。

紫色のテキストは、私が作成したAtomへのリンクを示しています。例えば、効率的市場仮説はいくつかの文献で取り上げられている概念なので、そのためのAtomを作りました。スクリーンショットの右下には、効率的市場仮説に言及する他のすべての書籍が表示されています。

何をAtomとして抽出し、何を抽出しないかを決めるには、ある程度の判断が必要です。単純な経験則ですが、他のソースで議論される可能性が高いと思われる場合や、そのアトムに具体的にアイデアをリンクさせると思われる場合は、アトムを抽出します。概念を抽出するかどうかを決定するプロセスは、常にメタレベルで自分のノートについて推論することになり、自分の思考に役立つ可能性があるかどうかを議論し、より高い抽象度でソースを見ることができるため、それ自体が有用である。

また、流動性を持たせることも重要です。最初のメモには、抽出されたアトムがあまり含まれていないことがよくありますが、後になって、著者が議論した特定のコンセプト（例えば、ブラックスワン）が、他のいくつかのソースで取り上げられていることに気づきます。その時は、重複を防ぐために、コンセプトをアトムに抽出し、すべてのソースがそのアトムにリンクするようにします。つまり、教科書Aのノートを取っているときでも、教科書BとCのノートをペインに表示し、どの部分をアトムに抽出できるかを確認するのです。例えば、最近、計量経済学のオンライン講座（一番左のペイン）を受講していたのですが、その中で移動平均モデルに言及していました。これは聞き覚えがあり、以前教科書（一番右のペイン）で扱ったことがあることに気づきました。そこで、教科書とオンライン講座の解説を1つのアトム（中央ペイン）にまとめ、両方のソースからそのアトムにリンクするようにしました。

ソース（特にブログ記事とTwitterスレッド）には、1つのコンセプトしか提示しないものがあります。この場合、1つの概念にしかリンクしないので、ソースノートを作成するのは無駄なことです。そこで私は「中抜き」してAtomを作り、ソースに直接リンクしています。

しかし、このTwitterスレッドが、より広範な論文の一部としてバークソンのパラドックスに言及しただけであれば、バークソンのパラドックスのアトムにリンクするソースノートにしたくなるはずです。

この記事のパート2では、さまざまなソースタイプに対応したソースノートの作成方法について、詳しいワークフローを紹介します。しかし、今のところ、いくつかの指針があります。

ノートは、ソースで議論されたすべての重要な概念に言及する必要がありますが、これらの概念のすべてを説明する必要はありません（説明は、関連する概念のアトムで行う必要があります）。

著者の論文を最もシンプルな形にすることを目指しましょう。

要するに、ノートは、すべての内容を繰り返すのではなく、ソースの中に何があるのかを教えてくれるものでなければなりません。私のノートはポインターを保存しています。

構造については、シンプルで柔軟なものを目指しています。一貫性は便利ですが、過大評価されています。ネストされた箇条書きを使うのは、抽象度が異なることを視覚的に強調するためです。トップレベルの箇条書きに目を通すことで、特定のソースの主旨を素早く感じ取ることができるはずです。さらに情報が必要な場合は、箇条書きの中に降りていくことができます。さらに情報が必要な場合は、元のソースを開くとよいでしょう。

Summary – Sources

私は、ソースをメモすることでソースを消費します。ノートを作成しながら、私は概念をアトムと呼ばれる個々のノートに抽出します。このアトムは、複数のSourceからリンクさせることができます。

Atoms

アトムは、既存の概念、技術、公式、枠組み、歴史的な出来事、または歴史上の人物を表しています。それはすでに存在するものであり、アトムはそれを私自身の言葉で説明したものに過ぎません。

アトムは、ウィキペディアのページを持つことができる知識です（実際、私のアトムの多くには、ウィキペディアの項目があります）。

アトムの機能は3つあります。それは、次のようなことです。

概念を説明し、かつての理解レベルを速やかに取り戻せるようにする（目標2：洞察力と理解力の維持）。

その知識が他のアトムとどのように組み合わされているかを示す（目標1：複雑なトピックを素早く学ぶ、目標3：O（N2）。

成長）。

より詳細な情報が必要な場合は、リソースを示してください。各アトムには、そのコンセプトについて私が見つけた「最高の」説明が書かれたソース（または単なるWikiページ/URL）へのリンクを添付すること。

Conveying understanding

私はいつも自分の言葉でアトムを書いています。これは、何かを理解する上で非常に重要なことです。私は、アトムを非常に簡潔なものにすることで、迅速にスピードアップできるようにすることを目指しています。特に、すべての詳細を把握するのではなく、自分の考えと関連する興味深い部分のみを把握することを目的としています。

例えば、ユリウス・カエサルのガリア戦線におけるアレシアの戦いに関するWikipediaのページは約4000ワードで、歴史的背景、包囲戦の詳細、死傷者数などを網羅しています。しかし、私の興味はユリウス・カエサルの同心円状の壁の建設に関する戦術にあるので、私のメモはわずか90字である（公平を期すため、文脈はガリア戦役の別のアトムに移されたのだ）。

Showing how a piece of knowledge fits in with other atoms

私は、アトムを他のアトムに自由にリンクさせています。さらに、ほとんどのアトムはソースを参照し、トピックで分類されています。これらによって、特定のアトムの文脈をより理解することができます。

Atoms as pointers

各アトムには、「参考文献」を記載しています。これは通常、そのAtomを論じたSource noteであるが、より一般的には、より多くを学ぶための「最良の」リソースへのリンクである。上の例では、BLUEについてもっと知りたいと思ったら、Reference（この場合はBen LambertのEconometricsのオンラインコースのSource note）をクリックして、BLUEが参照された文脈を見るでしょう。もしそれが十分でないなら、私のSource noteは元のリソースにリンクしています。

Summary – Atoms

私のアトムライブラリは、個人的なWikipediaのようなものですが、いくつかの重要な違いがあります。

私のライブラリには、私の思考に関連する（読むに値すると感じた情報源から発信されたという意味で）Atomだけが含まれています。

ウィキペディアのページは包括的であることを目指しますが、アトムはそうではありません。アトムは、自分にとって興味深い、あるいは関連性のある概念の側面だけをカバーする必要があります。

アトムは自分の言葉で書かれているため、失った理解を取り戻すのが容易であるはずです。

アトムは一度作ると、他のアトムとリンクしたり、他のアトムからリンクされたりします。これにより、概念と概念の結びつきをグラフィカルに示すことができる、アイデアのネットワークが生まれます。

Molecules

これまでのところ、モレキュラーノートは、重複を減らすことを目指した原則的なノートテイクのためのシステムにすぎません。これはこれでいいのですが、まだすべての目的を達成したわけではありません。

1. 複雑なトピックをミックスメディアフォームから迅速に学習する。

2. 洞察力と理解力を保持する

3. O(N2)

成長

4. 新しいアイデアの合成

5. 積極的な学習習慣の奨励

解決策です。分子（ゼッテルカステンのシステムでいうところの「パーマネントノート」）です。

モレキュールとは何か、それを説明するのは難しい。私ができることは、「分子とは洞察である」ということです。この洞察は、（それ自体で成り立つという意味で）自己完結的で個別的であるべきです。私のモレキュールは通常、2、3文からせいぜい1段落程度です。ほとんどの場合、分子は1つまたは複数の原子を「土台」にします（これが、そもそも私が分子を分子と呼ぶ理由です）。

もう少し具体的に、分子の種類とその例を紹介します。

私が持っているオリジナルの洞察で、多くの場合、何らかのソースからインスピレーションを受けています。(「オリジナル」というのは、「私が創作した」という意味です。私のアイデアの中に、これまでに考えられなかったという意味でオリジナルなものはないだろう）。

アトムにまつわる、私のオリジナルな考察です。

2つのソース間のリンク：例えば、2つのソースが同じコンセプトについて異なる方法で話していることに気づいたとき。

2つの原子間のリンク。

ソースに関連する知的なコメントの数々。

上記の例はすべて、「オリジナル」なアイデア、あるいは複数の知識のリンクです。しかし、モレキュールはオリジナルである必要はありません。私の「分子」の多くは、「情報源」に基づく洞察の結晶であり、概念的な藪の中で躓いた後に得た明晰な瞬間です。このような分子を作るのは、著者が伝えようとしているポイントを正確に理解し、それを自分の言葉で簡潔に説明できると感じたときです。

私は通常、そのアイデアを「自分の」直感の一部と呼んでも差し支えないほど内面化した場合のみ、（ソースの箇条書きではなく）「分子」にすることにしています。

Summary – Molecules

分子とは、私自身の、あるいは特定のソースから内面化した洞察のことです。分子を作ることが、モレキュラーノートの第一の目標です。

Topics

分子ノートでは、3つの基本要素（ソース、原子、分子）と共に、トピック（別名カテゴリー）を整理の原則とし て使用しています。

カテゴリー分けは、ノートテイカーの間で比較的議論のあるところです。ここでは、その両論を簡単に説明したいと思います。

スプレッドシート」派（私の専門用語）は、ノートを取る目的は、構造化されていない思考を高度に構造化され、提示可能でレビュー可能なものに変えることであり（だから「スプレッドシート」）、分類や整理は多いほど良いという考え方です。しかし、セカンド・ブレインの支持者の多くは、トップダウンの分類を否定し（例えば、「ノート・アーカイブにカテゴリーをつけるのは悪い考えだ」を参照）、創発的な構造を支持します - 彼らは、構造はリンクから有機的に生まれるべきだと考えています。

私は、真実はこの両極端の間のどこかにあると思います。意図的な構造も、カテゴリーやリンクといった創発的な構造も、どちらも有用だと思うのです。私の考えでは、構造は理解を助けるものであり、それによって知識の一部がどこに属しているのか、より良い地図を作ることができるからです。一方、純粋な創発（つまり、構造化されていないメモ書き）は、内容を見直すのが難しくなります。

従来のノート作成システムにおけるカテゴリの問題は、私が学ぼうとしている概念をサポートするにはあまりにも硬直した構造を助長してしまうことです。例えば、従来の「ファイルとフォルダ」のノートシステムでは、1つのノートが複数のカテゴリに属することは困難です。複数のフォルダにファイルを複製する必要があり、無駄が多いように感じます。これは「分類の麻痺」につながります。ある知識をどこに分類するか決められないことが、効率を低下させるのです（『ウォール・イー』でスポークを分類するのに苦労するシーンを思い出しますね）。

しかし、最新のソフトウェアでは、この懸念は解消されます。私が使っているObsidianでは、カテゴリは単なる空のメモであり、そこにリンクすることができます。好きなだけカテゴリーにリンクすることができます。カテゴリー」は排他的な感じがしますが、「トピック」は関連するテーマがあることを意味するだけです。

トピックの利点は、セカンドブレインに構造を与え、特定のコンセプトやリンクを探すために、グラフのどの領域を探せばよいかを把握するのに役立つことである。統計について学んでいるときは、統計のトピックのローカルグラフを見て、興味深いリンクがないかどうか確認することがよくあります。

もし時間が経って、あるトピックが自分にとって有用でないと分かったら（例えば、後でそれが具体的すぎたり広すぎたりしたと分かったら）、それを削除します。

第2回では、私がどのようにセカンドブレインを整理しているか、特にトピック、フォルダー、タグの使い方について詳しく説明します。

Summary – Topics

トピックは、Second Brainに構造を導入するためのシンプルで柔軟な方法です。トピックは、私のSecond Brainを検索し、可能なリンクを見つけることを容易にします。

Why Molecular Notes matters to me

一般的に、私は「生産性向上のためのYouTube」に対してかなり批判的です。典型的な例としては、YouTuberが生産性向上のためのツールを説明しているのですが、そのツールのほとんどが自分のYouTube動画を管理するために使われていることが明らかで、おそらく視聴者の大多数には当てはまらないような内容になっています。また、Zettelkastenのビデオでは、YouTuberの3つのゼットは「Niklas Luhmann」、「Zettelkasten」、「Linked thinking」です。アンディ・マトゥシャックはこう言っています。アンディ・マツチャックはこう言っています。「メモ書きについて幅広く書いている人たちは、その使い方を真剣に理解していることはほとんどない」。Cedric Cは、メンタルモデルに関しても同様の指摘をしています（リンク）。メンタルモデルについて書いている人の方が、メンタルモデルを効果的に適用している人よりもはるかに多いのです。

このような懸念は、このブログ記事を書く際の大きな障壁となりました。「生産性YouTuber」になることが怖くなったのです。これを書いている今も、私はMolecular Notesによって何ができるようになったのかを明確に説明することができないことに気づいています。

つまり、私が面白いアイデアを持っているとか、示唆に富むブログを書いているとか、私の考え方が好きだとか、そういうことは、すべて私の第二の脳によって実現されているということです。第二の脳によって生み出されたわけではありませんが、少なくとも増幅されたことは確かです。主観的には、セカンドブレインを使う前から学習意欲は旺盛でしたし、読んだ本の関連性を見抜くことも得意でした。しかし、ワークフローをMolecular Notesにコード化することで、大人になってからの制約を考慮しても、私の学習ペースは劇的に加速しました。これは弱い説明だと思います。私は本質的に、「第二の脳」を使うことで生産性が上がるから好きだ、と言っているのです。

もう少し具体的に言うと、Molecular Notesは、ヘッジファンドでのインターンシップの際に、高度に専門的な分野を素早く学ぶことができ、同時に関連分野との多様な関連性を見出すことができるため、（同じヘッジファンドでのフルタイムの仕事においても、現在も）具体的なメリットをもたらしてくれました。もっと具体的に説明したいのですが、残念ながら裁量の制約上、そうすることができません。それでも、私が伝えたいポイントは、「モレキュラーノートが実践で役立っていると思う」ということです。それは単なる「ブログネタ」ではなく、実はこの記事を書いたのは、何人かの方から独自に依頼を受けた後なのです。

Who is Molecular Notes for?

ゼッテルカステンやエバーグリーンのノート作成システムとは異なり、私のニーズはこれらの作成者であるルーマンやマトゥシャックのニーズとは異なるからです。ですから、私が既存のノート作成システムにアプローチしたのと同じ考え方で、モレキュラーノートにアプローチすべきです。

特に、Molecular Notesが（そのままでは）あまり適していないと思われる部分をいくつか挙げてみたいと思います。

クローズドブックの非小論文試験（特にSTEM科目）を受ける学生には、試験形式によりマッチし、スペーシングリピートを一流の市民として扱うノートテーキングシステムを使用することをお勧めします。私の大学のプログラムでは、すべてのコンセプトとテクニックを手元に置き、それを応用する練習をすることが重要でした。メタレベルでコンセプトを知ること（特に、異なるテクニック間の関連性を見つけること）は、それほど重要ではありませんでした。Obsidianは拡張機能によって間隔反復の機能を提供しており、パート2で説明するように、私はMolecular Notesで動作する独自の小さな間隔反復ツールをコードアップしました。RemNoteは間隔反復のために特別に設計されたもので、専任の開発者が機能を維持・向上させています。

第二に、モレキュラーノートのアイデアの多くは、特にソース間のつながりを探す機能など、学術的に非常に適切だと思いますが、論文からの引用の照合にもっと重点を置く必要があると思います。学術論文では、他の論文からの引用が役に立つことがありますが、『分子ノート』ではそれがほとんどありません。学術的な執筆を目的とするならば、オリジナルのZettelkastenシステムがより適しているかもしれません。

最後に、Molecular Notesは、現在進行中のイベントや新しい状況に対応するのではなく、常設のコンテンツに最適化されています（私のセカンドブレインは、プロジェクト管理ツールではないことを忘れないでください）。第2部では、これらの用途に対応するために、Molecular Notesをどのように修正できるかについて説明します。

Lay of the land – other note-taking systems

モレキュラーノートは、多くの先行技術に基づいています。モレキュラーノートの原理を紹介したところで、関連する他の2つのシステムと比較対照してみたいと思います。ゼッテルカステン（OG）とエバーグリーンノートです。

おそらく、このセクションを読んだ後、そのうちの1つがより自分に合っていると感じられるでしょう。私としては、それは素晴らしい結果だと思います。私たちはそれぞれ、自分の目標や学習スタイルに最も適したツールを見つける必要があるのです。

ゼッテルカステン

ソンケ・アーレンス著「スマートなノートの取り方」（私のハイライトはこちら）は、私がこれまで読んだ本の中で最も重要な本となったかもしれません。この本の中でアーレンスは、社会学者ニクラス・ルーマンが用いたノート術「Zettelkasten」について概説しています。Notionに実装されたZettelkastenは、私にとって最初の「思慮深い」メモの取り方だったのですが、後述する理由により、私のシステムは後に逸脱するようになりました。

Zettelkastenについては、ネット上にたくさんあるので（これは良い出発点です）、そのノイズを増やすことは躊躇われます。しかし、分子メモと対比するために、ゼッテルカステンのシステムにおける主なプリミティブは以下の通りです。

参考文献ノート：出典に関する書誌情報と、その出典の簡単な要約が記載されています。

文献ノート：出典の中で述べられている特定のポイントの要約。1つの出典を読むと、多くの個別の文献ノートが作成されます。

パーマネントノート（zettels）：あなたの洞察。

Eva Keiffenhamは、Zettelkastenの文献メモと永久メモの違いを概説する有用な図を掲載しています。

Obsidianに実装されたZettelkastenシステムを見たいなら、Artem Kirsanovによるこの動画が私が見た中で最高のウォークスルーです（警告：YouTubeにあるZettelkastenのアウトラインの多く/ほとんどは、せいぜい平凡なものです）。

私がZettelkastenから進化する必要があった主な理由は、確立された概念を扱うための優れた原始的な方法が欠けていることです。例えば、私が化学を学んでいて、アンモニアを製造するハーバープロセスについて学んだばかりだとします。これは私の思考にとって重要なことなので、ノートテイクシステムに含めたいと思います。ゼッテルカステンなら、文献ノート（読んでいる教科書を参照する）か、パーマネントノートでこれを記載します。しかし、どちらも理想的とは思えません。文献ノートに記載した場合、別の教科書でハーバープロセスについて少し異なる論考を読んだとき、私はその文献ノートを別に用意することになるのでしょうか。しかし、「既知の」概念に独創性のない説明を加えてゼッテルカステンの中に入れるのは奇妙な感じがします。

第二に、Zettelkastenの多くの側面は、ルーマンが使用した物理的な媒体（箱に入った文字通りの紙切れ）から生じたものである。文学的なメモを個別のノートとして持つという決断は、物理的な紙切れの文脈では理にかなっています（大きな文書を書くと再構成が難しくなる）。しかしデジタルシステムでは、ある資料からのすべてのメモ（または少なくともメモへのポインタ）を1つの文書にまとめる方がずっと簡単だと思います。また、ルーマンのオリジナルのZettelkastenでは、バックリンクを表現するために自明ではない命名規則が使われています。これは、デジタルZettelkastenでは明らかに不要なものです。

ルーマンがZettelkastenのシステムを考案したのは、より生産的な社会学者になるためだったことを忘れてはならない。私の理解では、社会学は主にさまざまな質的理論の分析に関わるもので、より小さな既知の事実や概念と、より大きな質的議論を扱うものです（これは決して社会学を否定するものではありません）。一方、STEM科目については、既知の概念や技法が満載の教科書があります。私は、これらの概念をいつ使うのか、それらがどのようにつながっているのかを学びたいのですが、ゼッテルカステンはこれには当然向いていません。

Evergreen Notes

Evergreen NotesはAndy Matuschakが開発したシステムで、Zettelkastenと多くの点で類似しています。マギー・アップルトンは素晴らしいビジュアルな説明をしていますが、基本的な真実はマトゥチャック自身のトピックに関する文章にあることは間違いありません。もしあなたがノートテイクに興味があるなら、この本は絶対に読むべきものです。私も同じような考えにたどり着きましたが、最初に彼の考えを読んでいれば、何時間も節約できたと思います。

Matuschakが書いていることのほとんどに同意しますが、彼のシステムが私にとってはうまく機能しない部分がいくつかあります。

まず、ソースノートがないことです。Matuschak氏が説明するように、彼のシステムは他人のアイデアを取り入れるというより、創造的な思考に最適化するように設計されているので、例えば教科書に直線的なメモを取るような素晴らしい方法はない。マツチャックのような博識な人には有効な方法でしょうが、私の人生の学習曲線からすると、教材にメモを取るための優れたシステムがあることはとても重要です。

第二に、彼はカテゴリーを一切使わない（この批判はZettelkastenにも当てはまる）。これは「Prefer associative ontologies to hierarchical taxonomies」という楽しいタイトルのパーマネントノートで説明されていますが、先に述べたような理由から、私はカテゴリー（Topic）は自分の知識のインデックスとして良い方法だと考えています。

続いて、構造化されていないため、彼のシステム（少なくとも公開版）は、特に検索機能やグラフビューがないため、非常にナビゲーションしにくい。Matuschak自身、この点を指摘している。

Summary – Molecular Notes in context

モレキュラーノートは、Zettelkastenに大きく影響を受け、Matuschakの革新的な技術を多く取り入れています（ただし、ほとんどは独自に到達したものです）。

モレキュラーノートの主な追加機能で、既存のシステムではうまく表現できていないと感じるもの。

リソース（情報源）から直線的なメモを取るための優れたワークフロー。

確立された概念のためのプリミティブ（Atoms）

フレキシブルとはいえ、トップダウンの構造（トピックス）

Failure modes

この記事の繰り返しのテーマは、Molecular Notesを自分にとってうまくいくように修正すべきだということです。しかし、その前に、あなたが避けるべきいくつかの失敗モードについて概説したいと思います。

カテゴリー分け地獄。

派手な分類方法を考え出そうとするあまり、時間を費やしてはいけません。

シンプルで柔軟なものを選びましょう。特定のニーズをより深く理解するために、その上に構築できるようなものを。

コンプリート主義。

セカンドブレインに無関係なことを書き足さない。

網羅的であろうとする誘惑に駆られるかもしれませんが、そうすると見直すのが難しいノートになります。

すべてのコンセプトが自分のメモに値するわけではない!

複雑なメタデータ。

新しいノートを作るときは、3つのフィールドを入れるだけでいいんです。「トピック」、「リファレンス」、「タイプ」の3つのフィールドだけです。

複雑なものは、ノートを作成する際の障害になり始めます。

コンテンツをコピーペーストする。

コピーペーストは、セカンドブレインの目的から外れてしまうのでNGです。

セカンドブレインの目的を達成することができません。また、記憶力を著しく低下させ、同時に完了主義を助長することになります。

ノートの取り方を意図的にしていない。

自動操縦に陥って、従来のノートを作ってはいけません。

モレキュラーノートでは、コンテンツに積極的に関わり、新しいソースを読みながら古いソースを再構築し、アイデアをリンクさせる機会を常に探していくことが必要です。

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